Lorsque les opérations militaires se font plus rares, Dayan qui est à présent intégré dans le dispositif permanent de la Haganah, se consacre à l’instruction. il est de plus en plus affecté à diverses sessions de formation en tant qu’instructeur militaire. Il est non seulement reconnu comme un combattant courageux mais également comme un excellent formateur. Il a développé une doctrine de combat et un programme d’entrainements originaux, comprenant des exercices sur le terrain, de jour comme de nuit, le développement du sens de l’orientation et de l’esprit d’initiative de ses élèves. En tant que commandant de la formation des officiers de pelotons, il a rédigé un manuel d’instructions pour les entrainements qu’il présente à l’État Major de la Haganah. Yaacov Dori qui dirige les formations de la Haganah et qui plus tard sera Chef d’État Major de Tsahal pendant la guerre d’indépendance, se montre très impressionné. Le manuel de Dayan n’est pas retenu intégralement mais bon nombre de ses idées qui s’y trouvent sont incluses dans la doctrine militaire des futurs jeunes commandants. Dayan est alors considéré comme l’un des instructeurs qui comptent et sa trajectoire vers le haut commandement semble tracée. Mais des évènements tragiques vont entraver son avancement.